gut, dann scheint das Script zu laufen, und du kannst wohl auch die Apache-Konfig mit .htaccess erweitern.
Teste mal:
# die folgende Zeile an deine beduerfnisse anpassen
Alias /perl-bin/ /usr/local/apache/perl-bin/
<Location /perl-bin/>
SetHandler perl-script
PerlHandler Apache::PerlRun
Options +ExecCGI
PerlSendHeader On
</Location>
Und versuche, ob du irgendwie an das Errorlog dran kommst, z.B. durch hinzufuegen der folgenden Zeile zum Block:
ErrorLog /usr/local/apache/log/error.log
wobei du den Pfad natuerlich an deine Beduerfnisse anpassen musst