Da kann man kaum was zu sagen, was hier besser ist. Der Schritt über die Mysql und dann wieder nach XML sieht irgendwie schon mal etwas überflüssig aus.
Du sagst aber auch nur, dass das ganze zu langsam ist. Wenn mans optimieren soll, wäre hilfreich zu wissen, wo die meiste Zeit verbraucht wird.
Frisst der Import in die Datenbank schon recht viel? Wie genau wirds in die DB importiert? Kann man am Import selbst oder an der DB vielleicht schon mal was optimieren?
Wie siehts mit den anderen Schritten aus? Wie lang brauchen die im einzelnen so typischer Weise?