noch ein kommentar:
abgesehen von der sehr merkwürdigen einrückung der zeilen im code schreibst du die datei mir newlines, aber ersetzen tust du beim lesen newlines und carriage returns. erstens sollte das immer nur \n sein, wenn du die datei immer nur auf demselben system liest und schreibst, zweitens entfernt man klassischerweise zeilenenden mit der funktion http://p3rl.org/chomp.

deine schleife beim schreiben der datei ist irgendwie unnütz. wozu eine schleife über genau eine variable?