Du könntest den Vergleichsstring ebenso mit "\n" beschreiben. Ist zwar unschön, aber dann überlässt Du perl die Umsetzung des "\n" in den entsprechenden Umbruch.



Alternativ könntest Du versuchen, die Ausgabe des Programmes ebenfalls über ein HERE-Dokument (wie Du es beim $expected tust) zu erstellen und die Zeilenumbrüche des Skriptes zu benutzen.