BernhardSchmalhofer hat Recht, wenn du nach einem halben Jahr oder länger deinen Code noch auf Anhieb verstehst, passt es.
Widme auch genügend Zeit, alles gut zu dokumentieren, für dich und für andere später.
Mit Perl::Critic hast du schon das richtige "Meckerkopf"-Modul, das dich auf seltsame Programmierkonstrukte hinweist, allerdings erzwingt es, je nachdem wie scharf du es einstellst, auch einen bestimmten Programmierstil.
Mit Perl::Tidy oder perltidy kannst du deinen Code schön formatieren lassen.
Nützlich kann auch noch die Ausgabe von B::Xref sein, mit der du eine Crossreferenzliste für deine benutzten Variablen und Subroutinen erhalten kannst.