Im Speicher werden die Daten doppelt gehalten. Einmal in $data und einmal in @lines das halte ich für einen Nachteil.

Die verhalten sich nicht mal äquivalent. beim einen werden die Newlines entfernt beim anderen nicht.

Außerdem kann es passieren dass zu wenige Daten gelesen werden. Ich bin schon auf Betriebssysteme bzw. Dateisysteme gestoßen die haben die komprimierte Größe deiner Datei angezeigt nicht die tatsächliche. Hättest du davon so gelesen hättest du 50-70% der Datei vergessen.