ich habe in meinem Homeverzeichnis ein .perl_libs Ordner mit dem ich über die Umgebungsvariable PERL5LIB verweise. Cpan lässt sich so einrichten, dass es, unter deinem Account, dahin die Pakte installiert.

Perl nimmt immer das erste passende Modul das es findet, kommen in @INC die selbst installieren Module vor denen von Debian, so werden diese genutzt.