Falls Du das in einer Schleife hast: Es würde schneller gehen mit einem prepared Statement. Prepared wird vor der Schleife und in der Schleife erfolgt dann nur das execute mit dem Wert für den Platzhalter im prepared Statement.

Prüfe außerdem, ob ein Index auf dem Feld liegt, welches in der Where-Klause angesprochen wird, das zeigt Dir explain.