2013-02-19T13:21:08 Student87

Die dritte Liste enthält aber unregelmäßige Bytezahlen pro Zeile.

Wenn du die 3. Datei nur sequentiell benötigst, ist das kein Problem - einfach Zeile für Zeile lesen. Wenn du aber random access benötigst, könnte dir ein Indexfile helfen, den du dir in einem Vorlauf erstellst. Von dort holst du dir mit seek die Startposition in der 3. Datei, die du dann wiederum mit seek ansteuerst.

Zeile x _schnell_ aus riesigem file raussuchen ?

Quote

eigentlich benötige ich diesen Array 2 x (Der zweite wird modifiziert -> Viele Stellen werden "maskiert")

Das klingt so, als gehörten diese beiden Arrays zusammen und sollten irgendwie zu einem Array zusammengeführt werden. Wenn das zutrifft, könnte man diesen Schritt vielleicht ebenfalls in einen Vorlauf auslagern.