Bei Tkx habe ich mich noch nicht mit Fonts befasst. Bei Perl/Tk gibt es die Option -font für alle Widgets, bei denen sie Sinn macht (einschließlich MessageBox).

Da Tkx sehr ähnlich zu Perl/Tk ist, sind die Chancen gut, dass -font auch bei Tkx::tk___messageBox funktioniert. Hast du es mal versucht?