2013-04-23T22:56:34 thomas38

Du öffnest die Datei (Schritt 1) und versuchst anschließend ein flock (Schritt 2). Somit ist sie bereits geöffnet.

Ja, und weiter?
Darin lag ja nicht das Problem, wie sich herausgestellt hat.

2013-04-23T22:56:34 thomas38

Meine Empfehlung:
Eine eigene Lock-Datei beim Start des Programms anlegen, sofern sie noch nicht existiert (als _ein_ Systemaufruf). Es ist kein Fehler, wenn die Datei bereits existiert.

Es geht hierbei nicht nur um eine Datei sondern um eine beim Programmstart noch nicht bekannte Anzahl Dateien.