Die Inkompatibilität bezieht sich wie gesagt nur auf C/XS-Code. Es gibt zwar ein paar Fälle, bei denen auch der Perl-Code inkomptabibel ist, aber das sind nicht die typischen Perl-Befehle.

Du könntest einfach bei allen Skripten und Modulen die uses rausziehen und diese dann installieren: (ich bin kein Könner bei Einzeilern)

Solche Konstrukte wie defined( %hash ) kannst Du ja einfach mit "Suchen und Ersetzen" loswerden.