MIME-Parser sagt dass das Encoding UTF-8 ist. Das ist so in den MIME-Header so deklariert und Perl akzeptiert das CESU-8 ja auch klaglos.

Es ist ja auch so dass die Mail multipart/alternative mit einem text/html und einen text/plain MIME Part ist. Im text/html Part ist dass
😀 - U+1F600 - F0 9F 98 80 - GRINNING FACE
korrekt als UTF-8 kodiert. Ich vermute dass das Mail-Programm beim Erzeugen des Plaintextes aus dem HTML Unsinn gemacht hat.