Meine persönliche Meinung: Ein Dateiupload sollte auch ohne JavaScript funktionieren. Ob du mod_perl oder CGI zum Upload nimmst, bleibt sich gleich, da Du auch mit CGI einen Prozess blockieren würdest. Ich würde aber mod_perl bevorzugen, da dies in meinen Augen sicherer ist.
Ich würde Upload und Beitrag schreiben nicht getrennt machen, da es mit Sicherheit viel häufiger dazu führt, das der Benutzer nicht mehr daran denkt, das er etwas hochlädt und somit Fehler produziert werden.