Unter Unix kann man netpbm in der Kommandozeile verwenden. Zum Beispiel:

wobei bild.ppm das eigentliche Bild ist und mask.ppm die Maske fuer die Transparenz ist.

Man muss aber nicht unbedingt ein .ico nehmen, ein .gif geht (wenigstens mit Mozilla) auch:
[html]<link type="image/gif" rel="shortcut icon" href="http://host/some.gif">
[/html]