mod_perl übergibt offensichtlich nicht die lage der quellcode-datei an den interpreter sondern den quellcode selbst.
$0 bzw. das filehandle 0 welches bei den Acme sourcefiltern benutzt wird, setzt aber die existenz einer realen datei voraus. die existiert wohl auch, deren position ist aber durch mod_perl verloren gegangen.
mit normalen cgi scripten sollte das aber funktionieren.

p.s. perl liefert dir aber auch ne menge möglichkeiten um deine programme so zu schreiben, dass sie keiner mehr lesen kann. Acme::Bleach is da noch verhältnissmässig einfach wieder rückgängig zu machen.