Danke erstmal für die Hilfe.
Ich muss mir erst mal Eure scripte genauer anschauen bevor ich da genau durchsteige, bin noch Anfänger.
@ Ronnie: Also um das mal genau zu spezifizieren.
In den Datensätzen sind experimentelle Daten, sogenante Spektren. Nun habe ich bei einer Messung ganz viele gleiche Spektren aufgenommen und will das Rauschen ausbügeln. Dazu muss ich diese Spektren mitteln. Also, nein, ich will eine Spalte (die pro Datenblock genau ein vollständiges Spektrum darstellt) über alle Datenblöcke mitteln und nicht pro Datenblock den Inhalt einer Spalte!

@Linuxer:
verstehe ich noch nicht so ganz. Wie spreche ich dann die Einzelnen Blöcke an, wenn ich mitteln muss? $_ hat ja immer nur den einen aktuellen Block in sich, oder? Ich muss die Werte ja Zeilenweise zusammenbringen. Also Zeile 1 vom ertsen Block (oder 1001), vom zweiten Block (1002), vom dritten Block (1003), usw.
Wenn ich den Datentrenner auf \n\n setze und dann chomp verwende, löscht mir das dann auch die eine Leerzeile, die dann noch im Array ist? Oder setze ich den Trenner lieber direkt auf \n\n\n (Ich muss ja das \n der letzten Datenzeile vor den beiden Leerzeilen mitnehmen, oder?)?