ich habe das vor jahren mal auf die folgende weise geloest:
1. das programm md5sum (oder so aehnlich) ueber ftp ausfuehren lassen
2. die datei hochgejagt
3. von der datei sowohl lokal als auch remote das md5-digest gezogen und die beiden verglichen

Achtung: das funktioniert nicht bei dateien, die im ASCII-Modus von Betriebsystemen mit unterschiedlichen Zeilenendungen uebertragen wurden (z.B Windows nach Linux etc.)