Mit suEXEC kann man allerdings keine Programme als root laufen lassen. Das steht explizit in der Dokumentation:

Quote

Presently, suEXEC does not allow root to execute CGI/SSI programs.

In meinen Augen ist es auch nicht gerade intelligent, ein CGI-Programm unter dem root Benutzerkonto auszuführen. Da gibt es bestimmt eine weniger radikale Lösung. Man muss Sicherheitsprobleme ja nicht herausfordern...