Kommt darauf an, was Du ausdrücken willst. :-)
IMO sind beide Sätze korrektes Englisch - allerdings mit unterschiedlichen Bedeutungen.

Ich tippe mal, dass Du "by" willst - Bedeutung: Du wählst über den Namen aus, welche Subroutinen importiert werden sollen. "with" bedeutet dagegen, dass auch die Namen importiert werden (zusammen mit den Subroutinen).