String mit Sequenz unterteilen: (war:Keine Ahnung wie ich das nennen...) (Allgemeines zu Perl)

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String mit Sequenz unterteilen: (war:Keine Ahnung wie ich das nennen...)

Leser: 1

Gast Gast

2007-06-17 02:01

Also ich bin blutiger Anfänger.
Ich will versuchen die Sequenz in Codons zu trennen. Also aca cag usw.

$sequenz= "acacagagatcgctagatcgatcgatcgat";

@geteilt= split (/(\w{3})/, $sequenz);

$a= 1;
foreach (@geteilt)
{ if ($a < @teil+1) {$a +=2}
}

print $geteilt[$a]." ";

Aber irgendwie kommt bei mir nur das 1. Codon und das war's dann.
Muss ich da noch ne Schleife einbauen??? Und wenn ja, wo???

renee

2007-06-17 02:45

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ModeratorIn

Was willst Du denn mit

Code (perl): (dl )

foreach (@geteilt)
{ if ($a < @teil+1) {$a +=2}
}

print $geteilt[$a]." ";

aussagen?

Was soll am Ende rauskommen?

In die dreiergruppen einteilen kannst Du so machen:

Code (perl): (dl )

#!/usr/bin/perl

use strict;
use warnings;

my $string = 'acacagagatcgctagatcgatcgatcgat';
my @values = $string =~ /(.{3})/g;

print $_,"\n" for @values;

OTRS-Erweiterungen (http://feature-addons.de/)
Frankfurt Perlmongers (http://frankfurt.pm/)
--

Unterlagen OTRS-Workshop 2012: http://otrs.perl-services.de/workshop.html
Perl-Entwicklung: http://perl-services.de/

MisterL

2007-06-17 02:54

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BenutzerIn
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Man müsste schon den ganzen Quellcode kennen. Was ist z.B. @teil ?
Aber vielleicht hat der Meister hier etwas Passendes parat: Beispielsuche mit Google

Gruss MisterL

“Perl is the only language that looks the same before and after RSA encryption.”

RPerl

2007-06-17 11:46

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BenutzerIn

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Vielleicht bekommst du auch mit subtr()
was gebacken

Beispiel:

Code (perl): (dl )

#!/usr/bin/perl

use warnings;
use strict;

my $string = 'acacagagatcgctagatcgatcgatcgat';

print substr($string, 0, 3); #aca
print substr($string, 3, 3); #cag

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