Wenn du bsw $H{'a'}->{'b'}->{'c'} = -foo setzt, dann wird sich der Wert auch in %H2 verändern, da nur die Referenz auf den Hash hinter 'a' umkopiert wird. Es zeigen also beide - $H{'a'} als auch $H2{'a'} - auf den selben Hash.
Bei einem deepcopy würde die gesamte Struktur kopiert.

MfG