mod_perl oder PPerl haben lediglich den vorteil, dass die scripte im speicher verbleiben und der inerpreter nicht bei jedem ausführen neu geladen werden muss. die eigendliche ausführung der scripte bleibt gleich schnell.
wenn dein script auf eine datenbank zugreift, würde ich eher versuchen die datenbankaufrufe oder den perlcode zu optimieren. einen "echten" perlcompiler, der perlcode in ausführbaren C code oder maschinencode umwandelt gibt es nicht.