So, ich habe nun ein wenig weiter herumgetüftelt und bin nun so weit:

Generell werden die Scripte nun ausgeführt! Das ist schon mal ein Erfolg.
Ein kleines Problem besteht jedoch immer noch: Ich erreich den Script Pfad nur über den Servernamen.de/cgi-bin/.... und nicht über MeineDomain.de/cgi-bin/...
Allerdings ist der richtige Pfad in der confixx_vhost.conf eingetragen. Hier mal eben die Auszüge:

httpd.conf

<VirtualHost x.x.x.x:80>
ServerName xxxxxxxx.de
#User confixx
#Group users
DocumentRoot /srv/www/confixx/html
Alias /phpMyAdmin /srv/www/htdocs/phpMyAdmin
php_admin_value safe_mode Off
php_admin_value safe_mode_exec_dir /srv/www/confixx/bin
php_admin_value upload_tmp_dir /srv/www/confixx/tmp
php_admin_value open_basedir none
ScriptAlias /cgi-bin/ /srv/www/confixx/html/cgi-bin/
CustomLog /var/log/apache2/xxxxx_access.log "%h %l %u %t \"%r\" %s %b \"%{Referer}i\" \"%{User-agent}i\""
ErrorLog /var/log/apache2/xxxxxx.de_error.log
</VirtualHost>



confixx_vhost.conf

<VirtualHost x.x.x.x:80>
ServerName domain.de
ServerAlias www.domain.de web1.servername.de
DocumentRoot /srv/www/web1/html
SuexecUserGroup web1 ftponly
ScriptAlias /cgi-bin/ /srv/www/web1/html/cgi-bin/



Wieso überschreib er nun nicht die Konfig der httpd.conf?
Ich hoffe mal jemand kennt das Problem...