Ich hatte mich mal mit einem ähnlichen Thema beschäftigt, leider aber nie eine wirklich tolle Lösung gefunden.

Druckausgabe mit Layout erzeugen

Ein Tipp war PDF::Reuse. Habe auch mal eine Lösung gesehen, die eine PHP-Datei entsprechen erzeugt und dann mit ezpdf ein PDF erzeuge wird.

Persönlich gefällt mir immer noch der "Umweg" über LaTex sehr gut bzw. über pdfTex. Sehr interessant finde ich die Lösung von Erco:

Stephan Lehmke: ERCOTeX - Datenbasierte Dokumenterzeugung mit LaTeX: Eine Fallstudie [Link]

Aber das geht wohl mehr in eine andere Richtung.

Zwischenzeitlich habe ich mir auch mal DocBook angeschaut.

Aber wie gesagt, außer ein paar Experimenten bzw. einigen Anpassungen in vorhandenen Systemen, habe ich noch nicht sehr viel damit gearbeitet.