objekt referenz an sub übergeben (Allgemeines zu Perl) - Perl-Community.de

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objekt referenz an sub übergeben

Tags: perl5 use Subroutinen Similar Threads

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+2 replies
guest Bilbo

2011-06-20 10:19
Hallo,

ich habe ein Bio::DB::Sam objekt und will dieses an eine sub übergeben. Das funktioniert auch bis dahin:
Code: (dl )

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sub sequencTest { my $bam = $_[0]; print "in module: $bam\n"; my $iterator = $bam->features(-iterator => 1); return;
Die sub ist in einem Modul mit Namen basicFuncs;
Methodenaufruf erfolgt einfach mit
Code: (dl )

1 2

require basicFuncs; my @array = basicFuncs::sequencTest($bam);
Das print gibt >>in module: Bio::DB::Bam=SCALAR(0x7ebb88)<< aus, trotzdem heißt es bei dem methodenaufruf >>Can't locate object method "features" via package "Bio::DB::Bam" at /home/..../src/lib/basicFuncs.pm line 77, <$FH_gtf> line 2<<

Bio::DB::Bam hab ich sowohl im Modul als auch in dem eigentlichen script eingefügt.

wie kann ich das beheben? ate jemand eine idee?
ciao

modedit Editiert von GwenDragon: cpan-Tags hinzu
Last edited: 2011-06-20 10:39:52 +0200 (CEST)
- topeg
  
  2011-06-20 10:47
  
  User since
  2006-07-10
  2611 articles
  BenutzerIn
  
  Vermutlich ist die von dir benutzte Version von Bio::DB::Sam zu alt und hat die Methode noch nicht.

View all threads created 2011-06-20 10:19.